Vous disposerez ainsi d'une palette d'outils destinés à la modélisation moléculaire. Vous pourrez ainsi ajouter toutes sortes de molécules et insérer des acides nucléiques ou des peptides en quelques clics.
Avogadro bénéficie aussi d'outils spécialisés en cristallographie, en rubans de protéines ou encore en conception de nanotubes. Parmi les nombreux modules complémentaires disponibles, certains améliorent notamment les propriétés du rendu et permettent d'effectuer des analyses scientifiques pointues.
Enfin, Avogadro est compatible avec un grand nombre de formats courants comme les fichiers CML, OUT, CIF, G98, G03, MOL, PDB ou encore HIN.




