Le logiciel gère les signets et permet de résumer les téléchargements qui n'ont pas pu être terminés. Il dispose d'une interface à la fois simple graphiquement et complexe permettant d'avoir des logs de connexion ou de choisir simplement le port FTP du serveur FTP via lequel une connexion sera effectuée.
A noter que neoFTP supporte une fois connecté les fonctions de création, renommage ou suppression des fichiers/répertoires, téléchargement de données et rafraichissement de la page en cours.